西方知识体系以「是」为核心算子，研究良基的存在者；它的精确边界是 ZF 集合论的正则公理。被正则公理排除的固有类——循环自嵌套、以自身为前提的结构——正是另一门科学的起点：以「生」为核心算子的生之科学。
研究对象
本体论问「这个存在者是什么」，这些问法都预设存在者已然在场；在「到来」之前，它保持沉默。这一沉默是结构性的，在意识、涌现、自指、生命生成与时空生成五处表现出来，共同根源是固有类。结构推论
固有类：其存在以自身为前提、构成循环的个体；被正则公理排除，数学家园是终余代数 νF（νF ≅ F(νF)）。此处「固有类」不取 NBG 中「过大而不能为集合」的技术含义。
定理级固有类 ↔ 终余代数 νF，以及由反基础公理（AFA）给出的互模拟身份判据，是贯穿全部文稿的唯一定理级锚点；有限情形可用 Paige–Tarjan 分划细化判定。
核心问题
- 存在者如何来到存在？——生成的问题，而非属性的问题。
- 两极如何同时涌现、互相定义？——互生的问题。
- 一个过程怎样维持自身？——旋机的问题。
方法
生之科学没有公理。它以本原方程（不动点方程）取代公理命题，以余归纳取代归纳，以自举演示取代一致性证明，并用自例化与守护性两条判据检验自身的合法性。道是算子而非最高存在者：不可公理化，只可算子化。结构推论
与存在之科学的关系
| 维度 | 存在之科学 | 生之科学 |
|---|---|---|
| 根本问题 | 存在者是什么？ | 存在者如何来到存在？ |
| 核心算子 | 是（BE） | 生（Shēng） |
| 对象 | 良基存在者 | 固有类（循环自嵌套个体） |
| 形式工具 | ZF 集合论、一阶逻辑 | 阴阳五行论；接驳 AFA、终余代数 νF |
| 认识论 | 顺序识别，有认知原点 | 循环识别，无认知原点 |
| 推理准则 | 保真 | 保生 |
| 方向 | 向上抽象（概率性） | 向下演绎（确定性） |
两门科学在概念层面（生／存在）互生对称；在体系层面是涵摄非对称：存在之科学是生之科学在存在独立性 ι→1 极限下的退化投影。退化不等于错误或低劣——退化投影在其论域内完整自洽，正是现代科学的全部成功所在。结构推论
体系结构
《生之科学》按生成环节而非学科分支编排，分为七编：甲界、乙道、丙生、丁运、戊形、己物、庚归。旧有的「生成本体论」「生成逻辑学」等学科称谓降为词典级对照名。